第三部，更多精采———
升上五年级后，被取消魔女资格的Doremi等人，还是一直在魔法堂花店工作。另一方面， 向12位元老院成员说明，尽管Doremi等人的魔法球破碎了，但她们的作为实在很伟大，并争取让四人再度成为魔女，此事在元老院中发生激辩，虽然有魔女哈特等人的赞成，但仍有半数元老院魔女 此提案。最后由 投下关键性的一票，但是避免争议，最后 决定以制作甜点并由这六个元老院成员作为评核员，若全部合格，就可让她们重新成为魔女，但要是有一人 ，Doremi等人则不能回复魔女身份。
因为升上五年级，所以学校重新分班。Doremi（在五年一班）因此和羽月、小爱及音符（在五年二班）等人分开，也因此多了许多新同学，和精采的故事。
有一天黄昏， 再次召回四人，除了暂时恢复四人的魔女见习生身份外，并介绍新成员—由美国返回日本的日侨“飞鸟桃子”来协助Doremi四人。小桃子因为父亲工作的关系，长年居于美国，因此虽然英文程度很好，但是日文却很不熟悉。当初小小桃子刚去美国时，因为外国人的身分，和不流利的英语，而交不到朋友。但是在遇到"魔女梦露"后，情形大为改善。梦露不但教导小桃子制作糕点的技巧外，还教她说英文，渐渐的，小桃子也认识了许多好朋友。 小桃子不小心发现了魔女梦露的魔女身分后，为了恢复其身分，所以认真的学习魔法和参加考试。但就在一级考试通过的那天，魔女梦露却因为年老体衰（1000岁以上），而撒手人寰。小桃子因此用了起死回生的禁忌魔法，最后不但失败了，还使自己的 球破裂。魔女梦露留给小桃子一只耳环当做纪念（小桃子现在戴在耳朵上的就是了）。最后小桃子和Doremi成为一班的同学。最后和大家相处后，小桃子不但日文越说越好，而且还认识了不少班里的朋友，尝试了不少新的事物（如品尝日本特色点心，剑道，挖番薯等），成为第三部时最活跃的角色。
因为魔女世界规定，小婴儿一旦一岁后，就要强制离开母亲的身边，改进入魔女幼稚园，小花也不例外。Doremi等人因为思念小花的缘故，常常偷偷跑去幼稚园偷看小花，却因为不小心出声，而引起小花思念母亲的心情。最后小花偷跑回人类世界找妈妈，引起了大骚动。最后妥协下，放宽限制让母亲们可以定期回去探望养女。
后半期，小花由于太思念Doremi等人，结果有一次用魔法把Doremi传送到魔女界，使前前任 惊觉小花有打开人间界与魔女界之门的能力，故前前任 对小花下了“讨厌蔬菜”的诅咒，以期达到不吃蔬菜而减弱小花魔力的目的。为了避免其他危险，小花再度送回给Doremi五人照顾。为了治好这个诅咒，期间五人要利用“梦幻食谱”，和她们的爱心，想办法让小花吃下蔬菜，进而协助小花解除诅咒（因为不吃蔬菜的关系，小花的魔力渐弱，头上的 球也黯淡无光，但只要吃下一道蔬菜，就有一颗珠子会恢复颜色，而加强魔力）。最后小花的诅咒被解除，前前任 利用桃子的悲伤回忆控制桃子，把小花带到诅咒森林，Doremi等人以及魔女界 等人也进入诅咒森林营救小花，最后因为小花的纯真，以及挚爱先夫的美味蛋糕“最心爱的道鲁宾”(道鲁宾为前前任 的本名)把前前任 怨气化解，诅咒森林亦因此消失了。Doremi五人也在(台译：糕饼师测验，港译：派蒂师考试)中，取得6位元老院魔女的同意，而再度取得魔女的资格。
第四部，咚尬！天上掉下来的礼物！再增加就改叫“早安魔女组”好啦———
没错，这的确是《小魔女DoReMi》第四部，而第四部也就是最后一部啰，因为小魔女们都已经升上六年级啦！小学的最后一年，小魔女们发生了什么事呢？
虽然已经确定成为魔女，但是还是必须等待一段时间才行，这段时间，小魔女们天天在魔法堂里仰首等待来自魔女世界使者的通知。很快地，开学的日子到了！这天，DoReMi的班上来了一个小女孩，这可吓坏了DoReMi和小桃子！因为她竟是小花！小花在魔法幼儿园哩，每天迫不及待想和DoReMi她们一起上学，于是大量使用魔法，把自己变成一个小六学生，而且连魔法堂的样子也改变了！但是小花过量使用魔法下，使得魔女一生只能拥有一个的“魔女水晶球”却破掉了。因此，魔女女王将自己的水晶球敲碎成六块，分给小魔女们，让小花也变成魔女见习生，并且必须通过魔女的九级考试。届时，大家才能一同成为魔女…
就这么一年加入一个小魔女，到了第四部，成员已经增加到了七个啦！（DoReMi的妹妹泡泡，在第一部中间也阴错阳差地成了魔女见习生），剧情当然也更加丰富啦！至于结果如何？就请您回家看东森幼幼台啰！
